Mapas
Prehistoria (65,000,000 A.C)
Es la época más antigua visitada en el juego, donde los humanos viven en tribus primitivas y luchan por sobrevivir contra criaturas prehistóricas y los Réptiles. La guerrera Ayla lidera a su pueblo, y durante este periodo cae del cielo Lavos, un ser extraterrestre que se entierra en el planeta y comienza a absorber su energía.
Edad Oscura (12,000 A.C)
En esta época existe una civilización mágica muy avanzada llamada Zeal, que vive en ciudades flotantes y utiliza el poder mágico para prosperar. La reina intenta aprovechar la energía de Lavos para obtener poder ilimitado, lo que provoca un desastre que termina destruyendo esa civilización y cambia el destino del mundo.
Edad Media (600D.C)
Durante esta era el reino de Guardia se encuentra en guerra contra un ejército de monstruos liderado por Magus. En medio del conflicto aparece el caballero Frog, quien busca vengar la muerte de su amigo Cyrus y detener los planes de Magus
Presente (1000 D.C)
Es la época inicial del juego, donde vive el protagonista Crono junto a su amiga inventora Lucca. Durante la Feria del Milenio, Lucca presenta un teletransportador experimental que, al interactuar con el colgante de Marle, abre accidentalmente un portal temporal que inicia toda la aventura
Día del Apocalipsis (1999 D.C)
En este momento ocurre el desastre que marca el destino del planeta. Lavos despierta de su largo descanso bajo la tierra y emerge a la superficie, causando una destrucción masiva que prácticamente acaba con la civilización humana.
Futuro devastado (2300 D.C)
Es un futuro arruinado por la catástrofe provocada por Lavos siglos atrás. El planeta se ha convertido en un desierto lleno de ruinas tecnológicas, y los pocos humanos que quedan sobreviven en refugios. En esta época el grupo conoce al robot Robo, quien se une a la misión para intentar cambiar el pasado y evitar el desastre.